More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0303 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  79.58 
 
 		 147 aa  228  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  77.24 
 
 		 146 aa  227  5e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  76.92 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  76.22 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  77.62 
 
 		 147 aa  222  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  75.35 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  74.65 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  62.07 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  61.87 
 
 		 166 aa  173  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  61.87 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  60.69 
 
 		 166 aa  172  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  60.43 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 163 aa  167  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  57.93 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  59.71 
 
 		 167 aa  166  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  56.64 
 
 		 206 aa  166  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60.43 
 
 		 182 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  58.62 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  59.86 
 
 		 168 aa  163  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.55 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  55.86 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  58.7 
 
 		 180 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  58.62 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 		 168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 		 168 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  55.8 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  57.97 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  54.68 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  55.17 
 
 		 166 aa  159  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  58.45 
 
 		 169 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  58.45 
 
 		 169 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.85 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  55.07 
 
 		 169 aa  158  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  57.75 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  56.94 
 
 		 168 aa  158  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  55.17 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  57.55 
 
 		 165 aa  157  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  57.75 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  62.22 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  62.22 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  62.22 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62.04 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  56.25 
 
 		 215 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  50.7 
 
 		 167 aa  153  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  50.69 
 
 		 168 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  58.27 
 
 		 197 aa  153  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 166 aa  153  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  53.62 
 
 		 189 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  51.41 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  51.03 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  49.31 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 		 167 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  47.92 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  47.92 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  51.41 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  52.41 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  52.14 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 168 aa  151  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  50.35 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5053  30S ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 190 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  57.55 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  61.19 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  61.19 
 
 		 202 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.72 
 
 		 163 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  51.37 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3431  30S ribosomal protein S5  54.41 
 
 		 190 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 203 aa  150  5e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  52.52 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  54.35 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  55 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 200 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3167  30S ribosomal protein S5  54.35 
 
 		 191 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.380109  normal  0.459785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1562  30S ribosomal protein S5  52.94 
 
 		 190 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>