282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0013 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  100 
 
 		 351 aa  713    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  62.22 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  61.65 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  62.5 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  65.09 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  61.93 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  62.71 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  61.54 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  60.91 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  60.97 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  61.45 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  55.52 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  55.74 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  65.93 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 384 aa  162  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  29.82 
 
 		 366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  28.27 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  25.09 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.82 
 
 		 730 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  31.45 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.23 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.39 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  32.76 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  23.99 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  28.12 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.7 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.52 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.51 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.16 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.76 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.36 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  27.57 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.15 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.64 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  28.77 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.05 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.78 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  27.01 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  26.32 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  23.58 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  23.4 
 
 		 912 aa  64.7  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.84 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.51 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  22.43 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  22.56 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  25.71 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  24.05 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.95 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>