More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9356 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  87.41 
 
 		 171 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  76.76 
 
 		 153 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  85.48 
 
 		 170 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  73.12 
 
 		 167 aa  221  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  73.33 
 
 		 188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  62.43 
 
 		 156 aa  207  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  67.48 
 
 		 164 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  67.44 
 
 		 169 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  65.09 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  59.69 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  76.86 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  65.29 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  76.86 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  67.55 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  60.82 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  60.82 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  60.82 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  57.3 
 
 		 188 aa  190  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  73.55 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  64.97 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  73.55 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  73.55 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  71.9 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  63.31 
 
 		 170 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  71.9 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  74.38 
 
 		 168 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  68.75 
 
 		 300 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  79.34 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  72.73 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  64.67 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  49.32 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  68.6 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  68.6 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  52.5 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  65.29 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  71.3 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  65.55 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  43.78 
 
 		 193 aa  157  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  54.96 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  61.16 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  52.9 
 
 		 179 aa  144  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  52.85 
 
 		 225 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  47.52 
 
 		 148 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  42.68 
 
 		 305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  50.41 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  55.37 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 148 aa  118  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  47.01 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  34.05 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 240 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  40.31 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  37.3 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40.19 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  35.42 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  35.16 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  35.71 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  34.72 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  34.72 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  41 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  36.91 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  36.91 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  32.3 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  36.91 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  43 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  31.87 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  39.8 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  39.39 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  40 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  37.19 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  43 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  32.88 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  39.58 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  37 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  28.06 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.22 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  38.78 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  35.65 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>