More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4114 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 386 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  46.54 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.43 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  44.88 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 420 aa  179  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  43.65 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.65 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.55 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  42.8 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  44.79 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  41.63 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  38.15 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  43.95 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  49.28 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.57 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  42.12 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  42.53 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  38.08 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  47.27 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  41.73 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.4 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  47.42 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36.83 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.13 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  43.09 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.15 
 
 		 271 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.64 
 
 		 372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.04 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  36.4 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  47.27 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.44 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40.26 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  40.38 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  36.25 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  38.36 
 
 		 417 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  46.08 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  43.65 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  37.07 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.82 
 
 		 369 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.35 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.79 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 444 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  40.59 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.98 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.36 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  42.06 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  44.49 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  40.63 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  34.88 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  36.08 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  42.69 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.24 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 869 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  38.43 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.67 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  39.76 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  39.06 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  38.65 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  43.58 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.82 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  41.51 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  40.37 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  42.06 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  37.91 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.94 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.32 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  42.58 
 
 		 442 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.93 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.64 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.16 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  41.31 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  43.12 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 612 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.93 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21890  histidine kinase  36.16 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  33.33 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3913  histidine kinase  36.4 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>