193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0919 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0919  LigA  100 
 
 		 328 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  72.24 
 
 		 352 aa  477  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  66.46 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  61.81 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  58.77 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  58.98 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.98 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.15 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.02 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  51.96 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.3 
 
 		 361 aa  298  7e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  50 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  52.91 
 
 		 379 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  48.41 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.88 
 
 		 385 aa  292  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  50.43 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  48.99 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  48.29 
 
 		 364 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  50.28 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  49.13 
 
 		 368 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  42.31 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  48.94 
 
 		 386 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.92 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.46 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  43.78 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  46.98 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  43.87 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.68 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  44.68 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  44.68 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  43.03 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.59 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.28 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  45.82 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  39.88 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  56.5 
 
 		 409 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  33.33 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.4 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.15 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  33.33 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  32.99 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  32.64 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.94 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.98 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  29.47 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.27 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.27 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  27.22 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  43.41 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  24.6 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.64 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  29.5 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.28 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  26.32 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.93 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.02 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  28.57 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  27.89 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.76 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.25 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.04 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  25.79 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  26.51 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.88 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.39 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  24.91 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.74 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 827 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  31.49 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  36.67 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  25.62 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.72 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  24.26 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0667  aminomethyltransferase, putative  26.23 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.5 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0660  folate-binding protein YgfZ  26.23 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.439221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3099  folate-binding protein YgfZ  29.58 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.623052 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  26.71 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  27.54 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  25.29 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.63 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  26.72 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  27.24 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  25.17 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  27.44 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  27.27 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.03 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.43 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.82 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.62 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  27.84 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  27.84 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  26.95 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  26.84 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.25 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  28.76 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.96 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.04 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>