90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0799 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  66.67 
 
 
164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  60.13 
 
 
165 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  64.9 
 
 
174 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  59.39 
 
 
168 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  53.75 
 
 
161 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  53.99 
 
 
169 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  57.5 
 
 
164 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  49.69 
 
 
170 aa  141  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  47.65 
 
 
159 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  46.43 
 
 
177 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  43.67 
 
 
166 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  46.34 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  46.34 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  46.34 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  45.45 
 
 
160 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  39.64 
 
 
172 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  42.38 
 
 
177 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  55.79 
 
 
160 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 
174 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  41.28 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  91.3  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  44.12 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  39.86 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  34.44 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  42.39 
 
 
162 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  36.13 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  37.14 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.01 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  40.86 
 
 
153 aa  58.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
161 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.52 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  36.26 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  38.32 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  34.03 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  37.04 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  29.59 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.35 
 
 
646 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  34.95 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  33.99 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  34.91 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  34.02 
 
 
180 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  33.02 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  35.64 
 
 
165 aa  48.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.65 
 
 
579 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  41.1 
 
 
183 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  37.33 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  29.25 
 
 
190 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  37.33 
 
 
182 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  32.95 
 
 
550 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  38.16 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25.95 
 
 
673 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.36 
 
 
512 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  31.08 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  23.13 
 
 
158 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  35.63 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  23.13 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  21.74 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  35.53 
 
 
658 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
153 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  34.52 
 
 
184 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.12 
 
 
177 aa  44.7  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  22.39 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  32.08 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  39.66 
 
 
498 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  36.25 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  33.71 
 
 
634 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  34.83 
 
 
507 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  23.6 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  34.65 
 
 
549 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  25.55 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  21.7 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  31.4 
 
 
491 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.65 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  35.9 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  23.13 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  29.6 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  34.62 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  31.71 
 
 
555 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 
632 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 
555 aa  41.2  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>