More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0051 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 121 aa  233  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  50.86 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  55.56 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  48.28 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  52.54 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  46.9 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  48.25 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  58.44 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  45.24 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  39.76 
 
 		 305 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  34.18 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  30.1 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  28.57 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  35.19 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  38.37 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  31.4 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  41.1 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  40.91 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  39.36 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.29 
 
 		 468 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  35.53 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  38.67 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  38.67 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1257  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.75 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0208  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 554 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  37.33 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  32.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  32.05 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>