91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3713 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  705    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  30.21 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  33.55 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  31.72 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  28.75 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  30.26 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.43 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  31.29 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.88 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.63 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  27.04 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  26.89 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  27.03 
 
 		 348 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  26.71 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  27.47 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  26.82 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  26.74 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  27.33 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.37 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  28.67 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.6 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  28.69 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  33.14 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  25.89 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  25.71 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.44 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.52 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  24.75 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  24.78 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.03 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  27.81 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  27.06 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  27.06 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  27.06 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.81 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  39.45 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.9 
 
 		 601 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  31.29 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  31.3 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.69 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  32.79 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  23.63 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  31.21 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.73 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  31.61 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  24.6 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  33.82 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  24.47 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  24.57 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  27.45 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.2 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  25.5 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  24.47 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  25.53 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  28.77 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.12 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  27.71 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.71 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.71 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  28.49 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  27.51 
 
 		 569 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  25.11 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  29.66 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  25.64 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.84 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  29.14 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.31 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  32.11 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  23.98 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.87 
 
 		 545 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  24.87 
 
 		 567 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  26.92 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  24.73 
 
 		 568 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  29.52 
 
 		 526 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.1 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.69 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  23.9 
 
 		 567 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  26.37 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.73 
 
 		 570 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  22.16 
 
 		 571 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  21.55 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.53 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  29.79 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  27.45 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  27.43 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  32 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.57 
 
 		 436 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  23.89 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.73 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  31.43 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>