256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1932 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 536 aa  1075    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1490  hypothetical protein  48.95 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1493  hypothetical protein  48.95 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2116  di-/tripeptide transporter  43.92 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2148  hypothetical protein  40.58 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2122  hypothetical protein  40.35 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0006  hypothetical protein  35.43 
 
 		 484 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.28636  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0003  hypothetical protein  36.16 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.992067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  29.26 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  29.26 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  29.06 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  29.06 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.86 
 
 		 501 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  30.31 
 
 		 495 aa  200  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  28.51 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  28.71 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  28.94 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  29 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.88 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  28.12 
 
 		 528 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  28.12 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  26.36 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  27.14 
 
 		 501 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  27.14 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  25.94 
 
 		 500 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  27.48 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  27.09 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  27.79 
 
 		 490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  27.41 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  27.06 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  27.06 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  27.06 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  27.08 
 
 		 489 aa  173  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  27.08 
 
 		 489 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  27.08 
 
 		 489 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  27.08 
 
 		 489 aa  173  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  27.08 
 
 		 489 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  26.85 
 
 		 489 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  27.37 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  27.37 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  27.37 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  27.37 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  24.86 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  27.95 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  27.03 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  27.03 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  25.84 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  24.15 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  27.79 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  25.34 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  25.92 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  26.75 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  27.67 
 
 		 496 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 603 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  28.76 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  26.2 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26.46 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  25.05 
 
 		 461 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  25.89 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  25.05 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  26.84 
 
 		 528 aa  143  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  26.67 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  25.05 
 
 		 461 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  26.34 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  26.68 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.77 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  25.25 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  24.28 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  24.23 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  25.98 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  27.25 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  25.35 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  24.09 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  24.27 
 
 		 539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  26.35 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  25.46 
 
 		 462 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  27.29 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  24.46 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  26.39 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  24.48 
 
 		 544 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  26.19 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  26.19 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  27.54 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  25.56 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  24.15 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  25.05 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  24.84 
 
 		 493 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>