233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0264 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  414  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  80.79 
 
 
203 aa  336  2e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.725e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  80.79 
 
 
203 aa  336  2e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  80.79 
 
 
203 aa  336  2e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  70.3 
 
 
203 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  67.16 
 
 
204 aa  283  1e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  67.16 
 
 
204 aa  282  3e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  68.32 
 
 
203 aa  280  8e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  65.69 
 
 
204 aa  277  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.19511e-05  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  69.61 
 
 
204 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  69.61 
 
 
204 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  69.61 
 
 
204 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  69.61 
 
 
204 aa  263  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  69.12 
 
 
204 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  66.67 
 
 
205 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  8.31038e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  66.67 
 
 
205 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.21216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  66.67 
 
 
205 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  66.18 
 
 
205 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  66.18 
 
 
205 aa  258  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.8448e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  66.67 
 
 
204 aa  258  5e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  66.67 
 
 
204 aa  258  5e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  66.18 
 
 
204 aa  257  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  67.16 
 
 
204 aa  256  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  55.05 
 
 
204 aa  220  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  53.73 
 
 
207 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  52.48 
 
 
207 aa  204  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  49.75 
 
 
207 aa  194  5e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  47.72 
 
 
204 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  54.59 
 
 
202 aa  189  3e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  45.96 
 
 
204 aa  182  4e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  55.74 
 
 
209 aa  181  5e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  179  3e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  45.45 
 
 
206 aa  179  3e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  43.15 
 
 
204 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  43.94 
 
 
204 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  2.52745e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  50.5 
 
 
210 aa  174  1e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  44.72 
 
 
204 aa  172  3e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  44.44 
 
 
204 aa  172  3e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69816e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  43.65 
 
 
204 aa  172  4e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  49.12 
 
 
176 aa  172  4e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  44.95 
 
 
204 aa  171  6e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  47.78 
 
 
208 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  44.85 
 
 
211 aa  168  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  43.72 
 
 
205 aa  165  3e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  42.78 
 
 
204 aa  164  7e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.8 
 
 
206 aa  164  1e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  41.29 
 
 
219 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  41 
 
 
211 aa  160  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.86376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  41.46 
 
 
242 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  40.86 
 
 
198 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.27558e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  41.58 
 
 
274 aa  150  9e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  44 
 
 
194 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  43.5 
 
 
194 aa  147  1e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  43.75 
 
 
213 aa  146  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  41.97 
 
 
239 aa  146  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  41.92 
 
 
197 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  42.54 
 
 
290 aa  145  4e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  43.15 
 
 
208 aa  145  4e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.33 
 
 
212 aa  145  4e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  42.05 
 
 
245 aa  144  7e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  43.15 
 
 
195 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  41.21 
 
 
201 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  5.82787e-07  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  39.08 
 
 
198 aa  141  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  37.99 
 
 
198 aa  140  1e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  1.64661e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.29 
 
 
198 aa  140  2e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  41.94 
 
 
194 aa  140  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  41.15 
 
 
197 aa  140  2e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.04 
 
 
201 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  39.29 
 
 
205 aa  139  4e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  42.41 
 
 
196 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  42.54 
 
 
195 aa  137  9e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  42.54 
 
 
195 aa  137  9e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  42.54 
 
 
195 aa  137  9e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  41.99 
 
 
204 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  41.99 
 
 
195 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.44 
 
 
195 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  41.44 
 
 
195 aa  134  6e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.88 
 
 
209 aa  134  7e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.11 
 
 
207 aa  134  1e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  6.70968e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.21 
 
 
195 aa  132  4e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  38.89 
 
 
193 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.48018e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  44.44 
 
 
213 aa  130  2e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  40.31 
 
 
196 aa  129  2e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.9 
 
 
210 aa  128  7e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  40.4 
 
 
197 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.16 
 
 
190 aa  125  4e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  40.4 
 
 
222 aa  125  4e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  40.91 
 
 
200 aa  125  4e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.13 
 
 
209 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40.88 
 
 
303 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40.88 
 
 
303 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40.88 
 
 
303 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  40.86 
 
 
194 aa  124  8e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  40.86 
 
 
194 aa  124  8e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  1.02941e-11  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.88 
 
 
196 aa  124  8e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>