238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  91.33 
 
 		 196 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  63.21 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  61.38 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  58.2 
 
 		 197 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  60.32 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  58.73 
 
 		 197 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  61.38 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  61.38 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  62.5 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  58.38 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  51.34 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  52.88 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  51.87 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  51.87 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  49.47 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  48.19 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  50.82 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  45.31 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  43.68 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  42.41 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  43.32 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  42.39 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  42.93 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  42.93 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  42.37 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.31 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  41.58 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.15 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.15 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.15 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.06 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.06 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.06 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  41.81 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  38.95 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.95 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  38.19 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.11 
 
 		 245 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.27 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  38.42 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.42 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.43 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  43.55 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  31.91 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  45 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.22 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  36.76 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40.34 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  36.32 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  33.67 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  37.17 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  37.57 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  37.7 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  39.47 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.76 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  39.53 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  41.41 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  39.47 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  39.47 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  35.36 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  37.7 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  39.47 
 
 		 303 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  39.47 
 
 		 303 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  30.93 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  41.26 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  46.26 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.57 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  39.27 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  36.22 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.45 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  30.65 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  39.04 
 
 		 274 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  39.15 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  38.95 
 
 		 303 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  31.94 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  29.47 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  36.98 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  39.85 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  36.13 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  36.81 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  39.58 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  39.58 
 
 		 212 aa  97.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  38.89 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  35.59 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.46 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  38.89 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  34.87 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.1 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>