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for query gene Spea_3956 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.25 
 
 
400 aa  651  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.75 
 
 
400 aa  634  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  80.5 
 
 
400 aa  668  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 
400 aa  794  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.69 
 
 
402 aa  611  1e-174  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.44 
 
 
402 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.19 
 
 
402 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  76.57 
 
 
402 aa  605  1e-172  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  73.68 
 
 
402 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.68 
 
 
402 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.93 
 
 
402 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  73.68 
 
 
402 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  76.44 
 
 
402 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  72.54 
 
 
401 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  71.54 
 
 
402 aa  577  1e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  70.96 
 
 
400 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  68.5 
 
 
400 aa  561  1e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  45.84 
 
 
401 aa  327  2e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  41.62 
 
 
397 aa  305  9e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.05 
 
 
389 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  45.45 
 
 
400 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  41.12 
 
 
423 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.78 
 
 
399 aa  234  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.66 
 
 
400 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.96 
 
 
397 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  5.19122e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.34 
 
 
397 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.34 
 
 
397 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  28.87 
 
 
396 aa  173  4e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  29.77 
 
 
396 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.01 
 
 
392 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  28.97 
 
 
396 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  31.69 
 
 
391 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
391 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  32.2 
 
 
371 aa  166  6e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  31.62 
 
 
391 aa  166  6e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  31.69 
 
 
391 aa  166  7e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  32.49 
 
 
371 aa  165  1e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 
402 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.97 
 
 
405 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.5 
 
 
401 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 
398 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  31.36 
 
 
395 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  31.07 
 
 
395 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  31.07 
 
 
395 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  33.43 
 
 
419 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  33.44 
 
 
414 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  31.07 
 
 
395 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 
405 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.79 
 
 
398 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 
398 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  30.79 
 
 
395 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.22 
 
 
425 aa  156  5e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.24 
 
 
404 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.07544e-08  unclonable  5.6227e-10 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.16 
 
 
396 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  28.97 
 
 
391 aa  156  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.7 
 
 
397 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.07 
 
 
398 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.24 
 
 
394 aa  154  3e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.50315e-07 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3944  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.33 
 
 
401 aa  153  6e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.08 
 
 
405 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.08 
 
 
405 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.25 
 
 
409 aa  152  9e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 
458 aa  152  9e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.3 
 
 
405 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.25 
 
 
401 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.28 
 
 
461 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.38 
 
 
452 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.42 
 
 
402 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  30.71 
 
 
401 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.22 
 
 
405 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 
399 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 
434 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.96 
 
 
386 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.86 
 
 
395 aa  149  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.4 
 
 
412 aa  148  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
399 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.97 
 
 
395 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 
393 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.05 
 
 
393 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
399 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.27 
 
 
409 aa  147  4e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  30.43 
 
 
400 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
393 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.40614e-05 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 
405 aa  146  7e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  29.53 
 
 
392 aa  146  8e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.28 
 
 
420 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.55 
 
 
391 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.95955e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.55 
 
 
409 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.22 
 
 
399 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.29 
 
 
401 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  30.53 
 
 
400 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.79 
 
 
393 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  29.27 
 
 
392 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.98 
 
 
415 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
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NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
414 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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