173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2138 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  670    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  38.34 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  40.73 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  39.19 
 
 
317 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  37.7 
 
 
315 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  38.28 
 
 
324 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  38.41 
 
 
305 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  37.5 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  37.84 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  37.84 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  37.83 
 
 
333 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  37.95 
 
 
311 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  36.04 
 
 
322 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  41.18 
 
 
173 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  41.43 
 
 
550 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  40.71 
 
 
550 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  40.71 
 
 
550 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  39.39 
 
 
137 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  38.64 
 
 
137 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  38.35 
 
 
137 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.88 
 
 
137 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  41.54 
 
 
135 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  35.82 
 
 
137 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.12 
 
 
548 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  33.08 
 
 
146 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  37.12 
 
 
137 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  36.67 
 
 
177 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  40.31 
 
 
541 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.36 
 
 
548 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  37.21 
 
 
138 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.06 
 
 
133 aa  89.7  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.94 
 
 
132 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  32.17 
 
 
155 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  36.43 
 
 
137 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  35.34 
 
 
136 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  38.71 
 
 
120 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  34.35 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.23 
 
 
132 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.17 
 
 
130 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  34.35 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.58 
 
 
136 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  28.47 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.59 
 
 
140 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  31.01 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  32.8 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.76 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  32.2 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.19 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.37 
 
 
148 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  31.06 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.39 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.06 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  28.46 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.91 
 
 
120 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  32.06 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.16 
 
 
130 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  30.83 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.4 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30.16 
 
 
130 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  34.86 
 
 
121 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  30.23 
 
 
136 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  32.03 
 
 
145 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  31.78 
 
 
132 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.88 
 
 
145 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  37.08 
 
 
136 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.08 
 
 
127 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  32.08 
 
 
127 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  32.48 
 
 
146 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>