183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1632 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  100 
 
 
394 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  54.76 
 
 
393 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  54.03 
 
 
385 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  51.91 
 
 
379 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  53.25 
 
 
409 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  48.83 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  49.1 
 
 
382 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  49.1 
 
 
382 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  49.1 
 
 
382 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  48.84 
 
 
382 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  49.1 
 
 
382 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  48.83 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  49.09 
 
 
382 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  48.83 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  48.83 
 
 
382 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  49.87 
 
 
383 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  48.83 
 
 
382 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  47.72 
 
 
386 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  49.61 
 
 
387 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  48.04 
 
 
382 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  47.97 
 
 
382 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  47.55 
 
 
386 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  51.43 
 
 
383 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  47.72 
 
 
405 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  50.65 
 
 
383 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  46.48 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  50 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  47.66 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  48.43 
 
 
384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  47.27 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  47.4 
 
 
388 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  46.63 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  44.79 
 
 
385 aa  333  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  46.74 
 
 
387 aa  325  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  43.12 
 
 
385 aa  324  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  46.74 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  41.93 
 
 
381 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  41.93 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  41.93 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  41.93 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  42.78 
 
 
391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  42.07 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  40.62 
 
 
381 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  39.84 
 
 
381 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  40.26 
 
 
381 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  40.26 
 
 
381 aa  288  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  40.26 
 
 
381 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  40.31 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.22 
 
 
404 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  40.51 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  38.67 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.34 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  39.32 
 
 
381 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.21 
 
 
398 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  36.96 
 
 
387 aa  262  8e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  37.09 
 
 
387 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  36.84 
 
 
387 aa  258  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  38.07 
 
 
386 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  38.62 
 
 
380 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.3 
 
 
394 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  37.08 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  39.57 
 
 
349 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  37.16 
 
 
388 aa  250  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  37.34 
 
 
403 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  42.59 
 
 
390 aa  249  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.63 
 
 
405 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  36.9 
 
 
389 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  35.95 
 
 
386 aa  246  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  37.92 
 
 
372 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  38.38 
 
 
396 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.5 
 
 
388 aa  239  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  41.94 
 
 
390 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  35.18 
 
 
399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.69 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  35.96 
 
 
386 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.71 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.29 
 
 
389 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.7 
 
 
385 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  35.73 
 
 
389 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  38.28 
 
 
376 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  33.83 
 
 
397 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.64 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  37.33 
 
 
389 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.52 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  38.3 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  33.97 
 
 
414 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  36.87 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  36.53 
 
 
348 aa  213  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  36.03 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  36.77 
 
 
399 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  37.11 
 
 
396 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.86 
 
 
383 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  30.88 
 
 
392 aa  210  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  32.21 
 
 
380 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  34.69 
 
 
356 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  36.69 
 
 
401 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  36.29 
 
 
358 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  33.24 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>