51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6832 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  30.56 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  34.67 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  27.13 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  27.13 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  26.29 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  29.67 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  32.5 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  31.79 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  31.79 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  31.79 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  34.16 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  34.26 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  27.75 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  27.14 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  24.88 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.22 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  28.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  26.67 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  28.69 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  33.88 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  31.3 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  31.33 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30.28 
 
 		 177 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  24.62 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 399 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  31.93 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  29.19 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.93 
 
 		 362 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  33.62 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  29.41 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  31.2 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1388  protein of unknown function DUF955  28.69 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.17 
 
 		 173 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  31.2 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2459  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  31.2 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  35.16 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.32 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  31.82 
 
 		 376 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  38.89 
 
 		 425 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  35.11 
 
 		 186 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0019  hypothetical protein  33.65 
 
 		 135 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  37.84 
 
 		 401 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  31.46 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  30.11 
 
 		 160 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  31.31 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>