More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2623 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  100 
 
 
648 aa  1282  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  95.68 
 
 
648 aa  1217  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  74.35 
 
 
650 aa  958  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  77.08 
 
 
649 aa  962  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  74.81 
 
 
649 aa  971  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  73.66 
 
 
653 aa  927  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  88.89 
 
 
648 aa  1146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  100 
 
 
648 aa  1282  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  89.04 
 
 
648 aa  1133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  88.58 
 
 
648 aa  1142  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  96.76 
 
 
648 aa  1233  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  89.04 
 
 
648 aa  1149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  76.12 
 
 
649 aa  987  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  76.85 
 
 
648 aa  946  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  76.12 
 
 
649 aa  967  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  48.02 
 
 
657 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  46.15 
 
 
720 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.55 
 
 
655 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  43.66 
 
 
654 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.85 
 
 
662 aa  482  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  41.11 
 
 
659 aa  446  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  40.96 
 
 
674 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  41.67 
 
 
660 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  41.21 
 
 
660 aa  440  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  40.46 
 
 
656 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
659 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  41.58 
 
 
659 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  39.56 
 
 
661 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  39.56 
 
 
661 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  39.39 
 
 
661 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.94 
 
 
680 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.81 
 
 
654 aa  417  1e-115  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
659 aa  417  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  38.47 
 
 
652 aa  419  1e-115  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  38.91 
 
 
668 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  41.11 
 
 
658 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  39.35 
 
 
678 aa  405  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
668 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
668 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  39.94 
 
 
667 aa  405  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 
667 aa  407  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.54 
 
 
668 aa  407  1e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
666 aa  407  1e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.11 
 
 
663 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.54 
 
 
669 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 
661 aa  400  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.63 
 
 
663 aa  400  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  40.65 
 
 
661 aa  402  1e-110  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  39.23 
 
 
670 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.54 
 
 
669 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.54 
 
 
669 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.54 
 
 
669 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  39.23 
 
 
670 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.54 
 
 
669 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.63 
 
 
666 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.54 
 
 
669 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  39.14 
 
 
664 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 
665 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  39.03 
 
 
655 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  38.92 
 
 
661 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  40.81 
 
 
661 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  38.25 
 
 
661 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
674 aa  369  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.08 
 
 
579 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.72 
 
 
671 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
636 aa  363  4e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.5 
 
 
570 aa  359  1e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.43 
 
 
697 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
666 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
672 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  40.46 
 
 
574 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
658 aa  341  3e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.97 
 
 
666 aa  336  8e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 
593 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  30.17 
 
 
682 aa  324  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.25 
 
 
572 aa  324  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 
741 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  36.93 
 
 
591 aa  322  1e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 
665 aa  322  1e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
666 aa  321  2e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 
664 aa  321  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  36.56 
 
 
568 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  35.39 
 
 
563 aa  317  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  35.89 
 
 
597 aa  316  1e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.88 
 
 
663 aa  315  2e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 
688 aa  314  3e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.04486e-09  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 
629 aa  313  5e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.19 
 
 
583 aa  313  7e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
656 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
665 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 
595 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  37.79 
 
 
597 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 
630 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 
630 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  33.56 
 
 
624 aa  310  7e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  33.1 
 
 
631 aa  309  8e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 
664 aa  309  1e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  34.97 
 
 
632 aa  308  2e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.16 
 
 
693 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
676 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>