207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0501 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.94 
 
 
1659 aa  872  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  35.47 
 
 
1683 aa  860  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  56.23 
 
 
1725 aa  1832  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.55 
 
 
1638 aa  877  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  35.05 
 
 
1739 aa  860  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  99.58 
 
 
1648 aa  3397  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  75.95 
 
 
1645 aa  2605  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.36 
 
 
1649 aa  771  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.29 
 
 
1649 aa  822  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 
1706 aa  855  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.6 
 
 
1705 aa  862  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.49 
 
 
1474 aa  660  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1648 aa  3406  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.91 
 
 
1638 aa  876  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  34.27 
 
 
1705 aa  850  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  1.60097e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  36.13 
 
 
1638 aa  896  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  95.02 
 
 
1648 aa  3258  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  35.95 
 
 
1634 aa  914  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  34.27 
 
 
1705 aa  850  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.53 
 
 
1669 aa  846  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  35.61 
 
 
1639 aa  885  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  36.09 
 
 
1265 aa  576  1e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  41.24 
 
 
1258 aa  569  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.52 
 
 
1199 aa  486  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  39.69 
 
 
1287 aa  485  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.73 
 
 
1293 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  39.08 
 
 
1298 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  38.61 
 
 
1298 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  40.54 
 
 
1300 aa  479  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  38.5 
 
 
1298 aa  476  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  38.38 
 
 
1298 aa  471  1e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.98 
 
 
1312 aa  467  1e-130  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  38.5 
 
 
1300 aa  461  1e-128  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
1399 aa  406  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  33.89 
 
 
1109 aa  387  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  29.61 
 
 
1406 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
1099 aa  305  5e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  30.05 
 
 
1099 aa  304  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  37.13 
 
 
1115 aa  304  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  2.04116e-09 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  35.98 
 
 
1116 aa  294  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  32.47 
 
 
1312 aa  282  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  31.52 
 
 
983 aa  264  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  30.9 
 
 
994 aa  252  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.94 
 
 
1000 aa  247  1e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  30.54 
 
 
971 aa  242  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  31.07 
 
 
1006 aa  227  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  31 
 
 
1045 aa  224  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 
1283 aa  217  1e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  30.01 
 
 
1042 aa  212  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  30 
 
 
1109 aa  189  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 
1292 aa  186  4e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
1286 aa  179  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  25.61 
 
 
1321 aa  179  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0984  hypothetical protein  40.81 
 
 
319 aa  174  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 
728 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  26.9 
 
 
1407 aa  152  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  26.9 
 
 
1407 aa  152  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  27.79 
 
 
1407 aa  151  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  26.17 
 
 
1406 aa  145  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 
1160 aa  142  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.1 
 
 
891 aa  130  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.13 
 
 
1124 aa  126  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  30.89 
 
 
962 aa  126  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  24.35 
 
 
917 aa  126  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  24.2 
 
 
917 aa  124  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  24.5 
 
 
917 aa  124  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  24.2 
 
 
917 aa  124  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  24.08 
 
 
917 aa  122  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  24.2 
 
 
917 aa  121  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  24.19 
 
 
917 aa  121  1e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  23.74 
 
 
917 aa  120  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  28.52 
 
 
1035 aa  120  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.89 
 
 
915 aa  119  4e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  28.11 
 
 
1570 aa  117  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  28.8 
 
 
1618 aa  118  1e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  23.59 
 
 
917 aa  118  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 
1323 aa  116  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.88 
 
 
860 aa  106  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  25.28 
 
 
1570 aa  101  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.6 
 
 
1234 aa  101  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  23.42 
 
 
1809 aa  99  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.96 
 
 
1570 aa  98.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  25.68 
 
 
1233 aa  98.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  24.4 
 
 
1962 aa  97.8  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 
1092 aa  94.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.37 
 
 
660 aa  94  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  37.99 
 
 
1324 aa  91.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.38 
 
 
860 aa  91.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  27.08 
 
 
1221 aa  86.7  3e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  23.54 
 
 
1215 aa  85.1  1e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.28 
 
 
1776 aa  85.1  1e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  23.16 
 
 
1220 aa  84  2e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.58142e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.76 
 
 
1060 aa  84  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.47 
 
 
1212 aa  84.3  2e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.17 
 
 
1383 aa  81.3  2e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  38.1 
 
 
1239 aa  80.1  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.19 
 
 
1078 aa  78.2  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.16 
 
 
1565 aa  76.6  3e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.57 
 
 
1106 aa  76.6  4e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.16 
 
 
1253 aa  76.3  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>