39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1405 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 352 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  62.22 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  52.38 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  46.88 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  48.19 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  42.7 
 
 		 402 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  31.37 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  32.8 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.61 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  31.27 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  28.45 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  29.78 
 
 		 421 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  29.83 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  30.33 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 816 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  31.25 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.47 
 
 		 382 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.12 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  29.21 
 
 		 384 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  28.93 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  29.86 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  27.6 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 394 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 368 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 		 398 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.33 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  21.64 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.81 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.17 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  20.77 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  20.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  19.02 
 
 		 434 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>