208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1085 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.38911e-08  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.46586e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.6984e-09  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.50012e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  94.47 
 
 
282 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.58327e-08  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  94.47 
 
 
282 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  94.86 
 
 
253 aa  480  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.5232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  93.68 
 
 
282 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.27515e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  93.28 
 
 
268 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  83 
 
 
253 aa  458  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  80.24 
 
 
253 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.60081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3723  putative lipoprotein  81.42 
 
 
268 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3500  putative lipoprotein  79.37 
 
 
282 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538329  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  80.16 
 
 
268 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2606  putative lipoprotein  76.77 
 
 
283 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.51596e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  80.88 
 
 
252 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3916  putative lipoprotein  51.19 
 
 
252 aa  267  9e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  51.88 
 
 
255 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  7.08503e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  50.21 
 
 
254 aa  261  5e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3266  putative lipoprotein  51.59 
 
 
257 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0237  putative lipoprotein  51.33 
 
 
253 aa  245  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.558058  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0663  outer membrane protein  52.86 
 
 
255 aa  234  1e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000502796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01004  hypothetical protein  50.93 
 
 
242 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004395  probable component of the lipoprotein assembly complex (forms a complex with YaeT YfgL and NlpB)  49.77 
 
 
242 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.83 
 
 
245 aa  228  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  47.68 
 
 
243 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  47.68 
 
 
243 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  47.68 
 
 
243 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.06829e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.2018e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.66686e-06  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.42 
 
 
245 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  2.81733e-07 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45 
 
 
245 aa  221  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.51049e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  44.58 
 
 
245 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  45.57 
 
 
243 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  46.46 
 
 
244 aa  216  3e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  46.9 
 
 
243 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  46.02 
 
 
244 aa  214  1e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  46.46 
 
 
243 aa  213  2e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  43.64 
 
 
254 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  40.34 
 
 
289 aa  197  1e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1603  putative competence lipoprotein precursor  40 
 
 
257 aa  195  5e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  39.34 
 
 
271 aa  194  8e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 
266 aa  194  8e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.71 
 
 
285 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  39.34 
 
 
278 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.46 
 
 
279 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  42.54 
 
 
281 aa  191  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  41.06 
 
 
337 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  38.49 
 
 
258 aa  188  6e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  41.03 
 
 
268 aa  184  1e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  37.79 
 
 
286 aa  184  1e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  40.5 
 
 
339 aa  183  2e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  40.08 
 
 
339 aa  183  2e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  42.59 
 
 
340 aa  183  2e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  40.5 
 
 
339 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  40.32 
 
 
301 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  42.99 
 
 
338 aa  182  4e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  40.5 
 
 
339 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3128  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.11 
 
 
269 aa  181  8e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  38.46 
 
 
261 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  6.18184e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  40.6 
 
 
330 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  39.43 
 
 
265 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  42.59 
 
 
338 aa  179  3e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  41.31 
 
 
254 aa  180  3e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  42.31 
 
 
341 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.31056e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  42.31 
 
 
341 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  38.59 
 
 
267 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2315  putative transmembrane protein  37.82 
 
 
268 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  39.83 
 
 
265 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  39.83 
 
 
300 aa  174  1e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  39.18 
 
 
262 aa  172  3e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  36.33 
 
 
253 aa  171  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  38.99 
 
 
255 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  38.99 
 
 
272 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  36.73 
 
 
257 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  36.73 
 
 
257 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3500  putative transmembrane protein  37.82 
 
 
263 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390268  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  40.19 
 
 
293 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  39.72 
 
 
293 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2004  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
274 aa  166  3e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.519821  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0877  DNA uptake lipoprotein  37.45 
 
 
277 aa  166  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04874  competence lipoprotein  33.61 
 
 
277 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1732  competence lipoprotein ComL  34.04 
 
 
274 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1705  competence lipoprotein ComL  34.04 
 
 
274 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158652  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  33.33 
 
 
274 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  37.55 
 
 
280 aa  164  1e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  33.33 
 
 
274 aa  164  1e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.33 
 
 
274 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.33 
 
 
274 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4485  putative transmembrane protein  37.18 
 
 
265 aa  164  1e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219271  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0920  putative transmembrane protein  34.63 
 
 
295 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>