More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  61.69 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1044  ATP synthase F1, gamma subunit  62.71 
 
 		 302 aa  361  9e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.645009  normal  0.129689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1299  ATP synthase F1, gamma subunit  44.63 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.64186 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  42.38 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.03 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  38.16 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.11 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.91 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.21 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.75 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.87 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.54 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.21 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.26 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.49 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  37.5 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.39 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  38.89 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.94 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.54 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.95 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  39.23 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.25 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0175  ATP synthase F1, gamma subunit  34.09 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.03 
 
 		 292 aa  192  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.29 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.41 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  35.24 
 
 		 315 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  36.51 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  38.41 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  38 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  39.07 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.42 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 		 286 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18210  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  36.58 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.141053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.97 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.63 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.42 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3631  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.22 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0034006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.09 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  36.18 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.57 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  37.25 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1071  ATP synthase F1, gamma subunit  36.15 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29560  ATP synthase F1 subcomplex gamma subunit  33.87 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.83 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.78 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1639  ATP synthase F1, gamma subunit  35.37 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.193163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  34.49 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  36.75 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  35.53 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.1 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1404  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.52 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.55 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1254  ATP synthase F1, gamma subunit  35.24 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.32 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.89 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.55 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  33.55 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  34.31 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.88 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.44 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  33.81 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.77 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0916  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.98 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00701907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.77 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.55 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>