More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07020  conserved hypothetical protein TIGR01033  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000405153  normal  0.306564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  81.58 
 
 
266 aa  453  1e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  1.17284e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03900  conserved hypothetical protein TIGR01033  80.52 
 
 
265 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.144849 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0323  protein of unknown function DUF28  69.66 
 
 
265 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125354  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  46.82 
 
 
251 aa  238  6e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.44 
 
 
252 aa  233  2e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  44.57 
 
 
255 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  2.18577e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  45.11 
 
 
248 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  46.21 
 
 
246 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  46.59 
 
 
246 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  46.56 
 
 
250 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.03 
 
 
252 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  43.56 
 
 
250 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  45.08 
 
 
249 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  44.36 
 
 
250 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  44.57 
 
 
252 aa  220  1e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  46.04 
 
 
246 aa  221  1e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  45.66 
 
 
246 aa  220  2e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  42.8 
 
 
249 aa  220  2e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.44 
 
 
254 aa  220  2e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  45.66 
 
 
246 aa  220  2e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  43.4 
 
 
251 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  45.98 
 
 
246 aa  219  4e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  43.13 
 
 
249 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  42.42 
 
 
249 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  44.44 
 
 
250 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  43.07 
 
 
251 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.88 
 
 
246 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  43.02 
 
 
251 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  44.91 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  44.91 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  44.91 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  44.91 
 
 
246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  45.59 
 
 
249 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  43.17 
 
 
253 aa  216  3e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  43.94 
 
 
249 aa  216  3e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  47.37 
 
 
252 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  43.98 
 
 
248 aa  215  6e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  45.28 
 
 
246 aa  215  6e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  43.23 
 
 
253 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  47.19 
 
 
251 aa  215  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  43.02 
 
 
251 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  44.53 
 
 
251 aa  214  1e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  44.53 
 
 
246 aa  214  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  45.49 
 
 
249 aa  214  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  43.61 
 
 
250 aa  214  2e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  43.61 
 
 
250 aa  214  2e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  46.61 
 
 
243 aa  213  2e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  43.61 
 
 
250 aa  214  2e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  44.69 
 
 
255 aa  214  2e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  44.53 
 
 
246 aa  213  3e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  41.57 
 
 
251 aa  213  3e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  45.28 
 
 
248 aa  213  4e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  44.07 
 
 
253 aa  212  5e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  42.64 
 
 
251 aa  212  5e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  45.69 
 
 
249 aa  212  6e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  43.02 
 
 
252 aa  211  8e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  43.3 
 
 
255 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  43.3 
 
 
250 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  43.56 
 
 
249 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  44.91 
 
 
250 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  44.53 
 
 
248 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  41.57 
 
 
251 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  44.31 
 
 
246 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  44.91 
 
 
248 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  41.76 
 
 
251 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  42.15 
 
 
251 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  43.61 
 
 
248 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  43.61 
 
 
247 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  44.91 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  44.15 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  5.47975e-05 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  43.7 
 
 
253 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  42.26 
 
 
251 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  43.77 
 
 
247 aa  208  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  42.91 
 
 
247 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  44.15 
 
 
247 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  43.77 
 
 
247 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  43.77 
 
 
247 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  43.77 
 
 
247 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  42.53 
 
 
255 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  42.53 
 
 
247 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  43.02 
 
 
247 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  43.07 
 
 
250 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  42.19 
 
 
252 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  43.02 
 
 
247 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  43.98 
 
 
250 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  43.98 
 
 
250 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2194  hypothetical protein  41.92 
 
 
244 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00428385  normal  0.442442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  43.4 
 
 
248 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  43.02 
 
 
247 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  42.05 
 
 
251 aa  204  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  41.22 
 
 
248 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  44.53 
 
 
247 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>