More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4059 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  56.28 
 
 		 572 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 566 aa  1145    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  45.72 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  46.52 
 
 		 583 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  45.99 
 
 		 550 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  43.35 
 
 		 550 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  42.62 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  40.72 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  40.61 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  37.28 
 
 		 570 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  38.73 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  37.27 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  36.66 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  33.45 
 
 		 546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  35.4 
 
 		 693 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  35.83 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  32.22 
 
 		 559 aa  279  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  32.66 
 
 		 559 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  35.69 
 
 		 639 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  29.96 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  36.81 
 
 		 636 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  37.2 
 
 		 644 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  37.83 
 
 		 668 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  32.47 
 
 		 645 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.43 
 
 		 658 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  35.56 
 
 		 701 aa  171  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  35.73 
 
 		 667 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  34.46 
 
 		 671 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  28.5 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  33.04 
 
 		 643 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  32.52 
 
 		 638 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  28.42 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  32.35 
 
 		 641 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  26.76 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  36.67 
 
 		 642 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  27.45 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  28.92 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.07 
 
 		 690 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.52 
 
 		 687 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  26.92 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  28.01 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  25.6 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  33.6 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  32.89 
 
 		 675 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  33.71 
 
 		 675 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 		 481 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.1 
 
 		 657 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  29.67 
 
 		 553 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  28.12 
 
 		 707 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  30.92 
 
 		 570 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.5 
 
 		 676 aa  137  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.39 
 
 		 682 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  31.27 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  27.57 
 
 		 680 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.47 
 
 		 707 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  25.31 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  29.07 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.01 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.16 
 
 		 706 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.22 
 
 		 681 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  27.67 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  24.33 
 
 		 708 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.15 
 
 		 765 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.47 
 
 		 702 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 		 994 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  28.38 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.1 
 
 		 692 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.72 
 
 		 706 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  29.81 
 
 		 507 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  28.43 
 
 		 679 aa  124  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  26.69 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  29.64 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.76 
 
 		 676 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  26.94 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 		 686 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.71 
 
 		 674 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  27.98 
 
 		 687 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  28.82 
 
 		 665 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.06 
 
 		 711 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  27.57 
 
 		 678 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  32.08 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.93 
 
 		 683 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5834  hydantoin utilization protein  27.63 
 
 		 687 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302011  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  26.07 
 
 		 983 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  30.54 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  23.29 
 
 		 710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.24 
 
 		 684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.46 
 
 		 660 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  28.86 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.11 
 
 		 680 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.06 
 
 		 681 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.03 
 
 		 684 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  24.83 
 
 		 708 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  29.37 
 
 		 999 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  27.52 
 
 		 680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.99 
 
 		 682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.04 
 
 		 690 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.23 
 
 		 692 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  26.68 
 
 		 676 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>