64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3239 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1834    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1140 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 2082 aa  191  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  39.79 
 
 		 1567 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  42.47 
 
 		 256 aa  160  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1030 aa  144  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.6 
 
 		 614 aa  139  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  27.92 
 
 		 386 aa  125  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.89 
 
 		 897 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  32.12 
 
 		 3320 aa  115  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  33.44 
 
 		 661 aa  111  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  34.31 
 
 		 622 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  23.8 
 
 		 714 aa  101  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  31.68 
 
 		 262 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  36.53 
 
 		 168 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  32.88 
 
 		 329 aa  94.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  36.47 
 
 		 187 aa  90.1  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.76 
 
 		 698 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  31.15 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  34.3 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  34.18 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.51 
 
 		 335 aa  70.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.01 
 
 		 597 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.42 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.02 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  27.44 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  32.54 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.4 
 
 		 356 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.02 
 
 		 324 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.68 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  30.65 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.84 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 332 aa  57.4  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  26.76 
 
 		 315 aa  56.6  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.68 
 
 		 355 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.12 
 
 		 365 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.54 
 
 		 323 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.54 
 
 		 323 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  24.72 
 
 		 354 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  26.01 
 
 		 382 aa  53.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  28.63 
 
 		 341 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.28 
 
 		 363 aa  51.6  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  29.47 
 
 		 361 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  27.05 
 
 		 319 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.23 
 
 		 342 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.57 
 
 		 369 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  27.33 
 
 		 340 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  27.3 
 
 		 363 aa  50.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  31.08 
 
 		 794 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  25.58 
 
 		 346 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.05 
 
 		 322 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.27 
 
 		 334 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.58 
 
 		 322 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.58 
 
 		 322 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.84 
 
 		 356 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  25.95 
 
 		 331 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  24.25 
 
 		 363 aa  46.6  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.75 
 
 		 313 aa  47  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0003  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1149 aa  46.2  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1024 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.68 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  28.73 
 
 		 338 aa  45.8  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  23.84 
 
 		 681 aa  44.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>