18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  100 
 
 
516 aa  1038    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  34.43 
 
 
1140 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.25 
 
 
1030 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  24.73 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  32.28 
 
 
931 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  35.16 
 
 
3320 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.43 
 
 
2082 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  28.67 
 
 
714 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.4 
 
 
897 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.44 
 
 
371 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.51 
 
 
661 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  33 
 
 
336 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  37.88 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.15 
 
 
334 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0962  hypothetical protein  30.43 
 
 
118 aa  44.3  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000546068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1044  hypothetical protein  31.67 
 
 
138 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  29.17 
 
 
168 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1353  GspI/GspJ family type II secretion system protein  37.29 
 
 
151 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0972416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>