275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1535 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  37.83 
 
 
244 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  42.74 
 
 
243 aa  168  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  38.75 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  36.69 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  37.39 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  34.62 
 
 
240 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  33.76 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  36.68 
 
 
244 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  34.6 
 
 
316 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  35.19 
 
 
229 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  35.65 
 
 
232 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  34.35 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  31.4 
 
 
217 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  30.52 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.09 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  38.68 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.73 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  28.77 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.87 
 
 
252 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.22 
 
 
251 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.67 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  36.36 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  29.29 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  30.66 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.22 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  26.51 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  27.6 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  22.62 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  32.14 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.27 
 
 
240 aa  89  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  28.96 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.17 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.65 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  28.96 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  23.98 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  38.38 
 
 
236 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  28.64 
 
 
300 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  35.71 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  27.73 
 
 
300 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  38.18 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  27.43 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  46.84 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  29.63 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  28.25 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.31 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  28.31 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.31 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  32.2 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  28.31 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.38 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  32.06 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  32.58 
 
 
244 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  23.18 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  23.18 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  27.65 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.64 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  31.25 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  26.03 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  24.15 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  36.27 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  32.69 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  25.65 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  33.6 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  30.39 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  23.26 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  32.11 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  28.77 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  26.58 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  41.89 
 
 
239 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  28.37 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  32.38 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  34.07 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  30.91 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.4 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  27.27 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  33.03 
 
 
278 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  29.09 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  24.43 
 
 
481 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.31 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  32.23 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  32.11 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  43.75 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0324  protein of unknown function DUF45  35.71 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00482569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>