245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1657 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1657  protein of unknown function DUF45  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0904  hypothetical protein  51.69 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  45.85 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  43.44 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  44.35 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  36.68 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  37.34 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  37.71 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0073  protein of unknown function DUF45  35.77 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.658711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0875  protein of unknown function DUF45  36.21 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2732  hypothetical protein  35.53 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  33.01 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  31.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  29.81 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1381  protein of unknown function DUF45  31.09 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.263783  normal  0.318048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.44 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.11 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  40.95 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  25.25 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  27.31 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  37.86 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  27.32 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  28.42 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  27.49 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  27.27 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.89 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  36.11 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0631  protein of unknown function DUF45  28.95 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0545956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2818  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608131  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  24.65 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  24.5 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  25.45 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  32.41 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  26.21 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  26.17 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  27.19 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  36 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  26.61 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  26.77 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  22.33 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  24.56 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  27.65 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  33.62 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  25.49 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  26.29 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  26.58 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  29.58 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  22.41 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  25 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  32.48 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  26.13 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.31 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  26.41 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  34.83 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  30.7 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  30.19 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  34.48 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  34.78 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  32.17 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  29.6 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  34.31 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  30 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  31.3 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  29.32 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  26.92 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  28.44 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  23.77 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  35.48 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  32.99 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  24.58 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7655  putative metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.66 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  24.24 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  34.78 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  25 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2977  hypothetical protein  30.77 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0331949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.38 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  25.36 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  35.87 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  31.5 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  35.87 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  26.55 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  34.78 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  34.78 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  34.78 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>