More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1377 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
411 aa  845  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 
417 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 
415 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  65.69 
 
 
415 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
415 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.67671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
413 aa  564  1e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 
414 aa  563  1e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 
415 aa  561  1e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 
415 aa  563  1e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 
412 aa  562  1e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 
420 aa  561  1e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 
415 aa  561  1e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  65.93 
 
 
417 aa  561  1e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  68.07 
 
 
414 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 
417 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
416 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 
412 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 
417 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 
415 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
418 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  65.51 
 
 
417 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.0982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
412 aa  541  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
413 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 
410 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 
410 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
413 aa  540  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
416 aa  539  1e-152  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 
412 aa  540  1e-152  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 
419 aa  539  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.84892e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 
412 aa  540  1e-152  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 
412 aa  540  1e-152  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 
411 aa  540  1e-152  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.28494e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 
412 aa  540  1e-152  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 
412 aa  541  1e-152  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
412 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 
417 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
413 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
412 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 
413 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.38182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
413 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.29833e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 
422 aa  527  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.15106e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
415 aa  526  1e-148  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
414 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  4.68931e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  3.58223e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
414 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
414 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.94889e-09  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
427 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  6.92081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 
413 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.66706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
413 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
416 aa  518  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
415 aa  520  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
414 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
412 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 
412 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
427 aa  514  1e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
427 aa  514  1e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 
418 aa  517  1e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 
413 aa  516  1e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
414 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
412 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
420 aa  512  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 
424 aa  514  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 
438 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 
439 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 
438 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
415 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
414 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 
415 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
422 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
415 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 
414 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
415 aa  506  1e-142  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
417 aa  508  1e-142  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 
427 aa  505  1e-142  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 
414 aa  507  1e-142  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
418 aa  505  1e-142  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
419 aa  505  1e-142  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
418 aa  507  1e-142  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 
415 aa  505  1e-142  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
415 aa  504  1e-142  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
415 aa  506  1e-142  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
415 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
415 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
419 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
436 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
431 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 
415 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 
416 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
417 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>