More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0025 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0025  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344249  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0116  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.241411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0621  putative ferric uptake regulator, Fur family  35.71 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2211  ferric uptake regulator family protein  34.85 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0164  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1728  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0128  ferric uptake regulator family protein  34.29 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3379  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3702  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1233  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3496  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0048  putative transcription regulator protein  35.29 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1467  transcriptional regulator, Fur family  30.66 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.225207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1183  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.837957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0533  ferric uptake regulator, Fur family  34.78 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3018  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0481144  normal  0.294593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  32.14 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2512  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.450617  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  29.29 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  31.01 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0747  ferric-uptake regulator  31.58 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0931  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  27.34 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3895  ferric uptake regulator family protein  31.85 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.845515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  34.44 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  26.62 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  29.41 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.68 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  34.44 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  29.63 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.29 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  34.07 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  33.1 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1604  putative transcription regulator protein  30.66 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000436344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1930  ferric uptake regulator, Fur family  25.19 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  27.27 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  32.97 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  26.12 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4566  Fur family transcriptional regulator protein  29.41 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  29.17 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  34.81 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0593  ferric uptake regulator family protein  29.85 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.211078  unclonable  0.00000627235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2685  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0992523 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  39.18 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  26.53 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  27.54 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  27.94 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1140  ferric uptake regulator family protein  32.31 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3640  hypothetical protein  33.79 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0132  ferric-uptake regulator  24.22 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  26.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  26.39 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1991  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  25.55 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  27.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  30.77 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3292  FUR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000231053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  28.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  31.39 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  28.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  26.87 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  28.67 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0263  FUR family transcriptional regulator  31 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  25.71 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2987  FUR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  27.34 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  30.77 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  24.82 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1453  ferric uptake regulator, Fur family  29 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>