141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3970 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 155 aa  326  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  72.18 
 
 		 134 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  65.67 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  64.39 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  64.39 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  64.62 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  63.85 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  64.62 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  64.62 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  64.62 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  64.62 
 
 		 136 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  63.64 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  68 
 
 		 132 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  60.9 
 
 		 134 aa  183  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  63.28 
 
 		 134 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  59.23 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  50 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  44.72 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  43.55 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  39.2 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  39.2 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  39.2 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  35.94 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  36.51 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.57 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  22.3 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  28.89 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  27.56 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  24.44 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  25.2 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  25.23 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  22.41 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  27.97 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.43 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  26.77 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  25.38 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>