More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2228 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  53.17 
 
 		 682 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  53.31 
 
 		 682 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2447  carboxy-terminal protease  79.21 
 
 		 681 aa  1141    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 680 aa  685    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 682 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  55.1 
 
 		 683 aa  722    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  53.96 
 
 		 671 aa  708    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  52.06 
 
 		 673 aa  681    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  78.33 
 
 		 682 aa  1125    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 682 aa  685    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  56.33 
 
 		 664 aa  757    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  79.65 
 
 		 681 aa  1148    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  52.64 
 
 		 682 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  57.46 
 
 		 665 aa  772    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  57.27 
 
 		 672 aa  763    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  54.8 
 
 		 689 aa  710    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  54.01 
 
 		 678 aa  691    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 680 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  54.95 
 
 		 690 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  53.17 
 
 		 682 aa  685    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  79.65 
 
 		 681 aa  1149    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  79.71 
 
 		 690 aa  1146    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 682 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  79.3 
 
 		 681 aa  1134    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  53.39 
 
 		 698 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  54.19 
 
 		 671 aa  710    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  57.45 
 
 		 668 aa  757    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  53.39 
 
 		 682 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  53.39 
 
 		 682 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2440  carboxy-terminal protease  79.36 
 
 		 681 aa  1144    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  78.83 
 
 		 683 aa  1120    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  53.39 
 
 		 682 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  58.92 
 
 		 680 aa  787    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  51.84 
 
 		 673 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  60.12 
 
 		 679 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  79.57 
 
 		 690 aa  1135    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  53.39 
 
 		 682 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1673  carboxy-terminal protease  79.21 
 
 		 683 aa  1149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1748  carboxy-terminal protease  79.21 
 
 		 683 aa  1149    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0158568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  100 
 
 		 683 aa  1403    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  78.62 
 
 		 681 aa  1120    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1778  carboxy-terminal protease  79.36 
 
 		 683 aa  1151    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  53.17 
 
 		 682 aa  685    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  78.48 
 
 		 681 aa  1123    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  54.95 
 
 		 692 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  77.97 
 
 		 681 aa  1115    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  55.92 
 
 		 664 aa  737    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  49.26 
 
 		 675 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  42.2 
 
 		 693 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  42.75 
 
 		 704 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 		 709 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  42.38 
 
 		 698 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  0.00000629787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  43.38 
 
 		 699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  42.41 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  42.12 
 
 		 704 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  42.05 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  43.24 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  43.09 
 
 		 704 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  43.09 
 
 		 704 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  42.77 
 
 		 725 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  41.75 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  44 
 
 		 719 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1593  C-terminal processing peptidase-1  41.22 
 
 		 708 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 		 698 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  40.06 
 
 		 727 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  39.38 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  41.16 
 
 		 705 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 		 705 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 		 709 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  39.72 
 
 		 698 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  40.09 
 
 		 703 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  38.55 
 
 		 693 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 		 721 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 726 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  38.45 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  40.36 
 
 		 694 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  36.52 
 
 		 688 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  36.46 
 
 		 680 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  36.4 
 
 		 707 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  38.9 
 
 		 687 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0729  peptidase S41A, C-terminal protease  39.36 
 
 		 683 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 674 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 697 aa  425  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 674 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 683 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3496  carboxyl-terminal protease  34.52 
 
 		 743 aa  360  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.847425  normal  0.281142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  32.1 
 
 		 735 aa  346  8e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1631  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  31.71 
 
 		 737 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  31.71 
 
 		 737 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0003  carboxyl-terminal protease  32.81 
 
 		 702 aa  324  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  32.82 
 
 		 711 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  34.73 
 
 		 706 aa  316  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  32.33 
 
 		 719 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305852  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1430  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 727 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  27.75 
 
 		 676 aa  187  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  27.36 
 
 		 705 aa  181  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  33.33 
 
 		 649 aa  169  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>