More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1904 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  40 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  37.88 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  33.45 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  35.17 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  31.76 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  34.16 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  32.04 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  35.61 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  38.13 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.84 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  33.1 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  33.57 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  32.74 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  34.1 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  30.3 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  31.62 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.28 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  28.99 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  33.21 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  30.74 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  31.05 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.82 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.76 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.61 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.7 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.27 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.52 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.02 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  25.96 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  30.67 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.99 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.53 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.99 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.15 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.27 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.32 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.44 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.54 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.54 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.37 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.03 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.34 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  28.43 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.33 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  24.23 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  24.23 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  24.23 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  26.15 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.32 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  26.99 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  25.31 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.56 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.44 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.85 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.68 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  28.96 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  28.63 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  26.63 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  26.73 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl514  fructokinase  27.11 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  23.67 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.31 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  26.32 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  26.8 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  27.12 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  25.64 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  26.8 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  29.02 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  26.96 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  24.74 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  26.4 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  24.92 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.92 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>