More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4403 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  83.33 
 
 		 530 aa  900    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.53 
 
 		 530 aa  903    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.78 
 
 		 530 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.42 
 
 		 516 aa  1058    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 		 516 aa  1063    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.33 
 
 		 530 aa  900    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.78 
 
 		 530 aa  868    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  81.4 
 
 		 530 aa  868    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  67.05 
 
 		 517 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  78.29 
 
 		 521 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  83.14 
 
 		 530 aa  898    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 530 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 		 516 aa  1063    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  82.95 
 
 		 530 aa  863    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  99.61 
 
 		 516 aa  1060    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  100 
 
 		 516 aa  1063    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  75.58 
 
 		 530 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  55.32 
 
 		 520 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.43 
 
 		 520 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  53.4 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  55.85 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.23 
 
 		 522 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.65 
 
 		 520 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.65 
 
 		 520 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.04 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.23 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  52.04 
 
 		 522 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.84 
 
 		 509 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  51.84 
 
 		 509 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  51.06 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.67 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.79 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.09 
 
 		 518 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  26.53 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  28.54 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  28.07 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.08 
 
 		 538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.78 
 
 		 497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.24 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25.78 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  28.34 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.72 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  28.51 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1194  carbohydrate kinase, FGGY  27.83 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.36 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.23 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  27.1 
 
 		 524 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.03 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  27.2 
 
 		 519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.72 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.65 
 
 		 481 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.38 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.69 
 
 		 512 aa  163  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.4 
 
 		 510 aa  163  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  30.94 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  27.22 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  25.58 
 
 		 506 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  27.22 
 
 		 513 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.02 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.53 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.53 
 
 		 513 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.53 
 
 		 513 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  27.22 
 
 		 513 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.74 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  26.53 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  27.02 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  26.36 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.21 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  26.31 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.21 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  28.29 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.15 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  28.88 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  26.74 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.39 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3610  carbohydrate kinase FGGY  30.83 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  27.49 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  27.34 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  26.2 
 
 		 496 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  28.23 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.46 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.79 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  27.08 
 
 		 519 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.25 
 
 		 508 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  23.87 
 
 		 506 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  27.72 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  25.2 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  27.11 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  25.76 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  26.76 
 
 		 519 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.89 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  26.69 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  26.69 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.72 
 
 		 496 aa  143  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  25.73 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  26.56 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  25.3 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  26.56 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  25.3 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>