283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3050 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3800  serine protease  68.5 
 
 		 1215 aa  1610    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.76 
 
 		 1212 aa  1582    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.76 
 
 		 1212 aa  1581    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  100 
 
 		 1220 aa  2474    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  68.84 
 
 		 1212 aa  1583    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  74.29 
 
 		 1212 aa  1814    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.51 
 
 		 1049 aa  291  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.29 
 
 		 1323 aa  231  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.37 
 
 		 1092 aa  198  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  27.39 
 
 		 1407 aa  184  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  27.25 
 
 		 1407 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.44 
 
 		 891 aa  179  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  27 
 
 		 1406 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1407 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 		 1383 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  28.49 
 
 		 1221 aa  155  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.22 
 
 		 860 aa  154  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 		 728 aa  154  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  28.03 
 
 		 917 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  28.03 
 
 		 917 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 		 883 aa  153  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  27.01 
 
 		 917 aa  152  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  28.23 
 
 		 917 aa  152  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  27.63 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  28.03 
 
 		 917 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.5 
 
 		 915 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.92 
 
 		 917 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  27.26 
 
 		 917 aa  148  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.39 
 
 		 1283 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.39 
 
 		 1234 aa  147  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  26.94 
 
 		 917 aa  144  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0392  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 		 1075 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  26.83 
 
 		 1042 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.42 
 
 		 1292 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.15 
 
 		 1286 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 		 860 aa  136  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 		 1776 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.73 
 
 		 1618 aa  126  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  27.73 
 
 		 1321 aa  125  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.58 
 
 		 1124 aa  124  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  29.96 
 
 		 1570 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 		 1160 aa  124  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 660 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1109 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.38 
 
 		 1565 aa  111  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.33 
 
 		 1199 aa  108  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  27.08 
 
 		 2042 aa  106  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.07 
 
 		 1035 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01380  peptidase, putative  28.61 
 
 		 950 aa  102  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  26 
 
 		 1258 aa  102  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  25.16 
 
 		 1265 aa  100  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.79 
 
 		 1638 aa  99.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  23.9 
 
 		 1725 aa  99.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1639 aa  99  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  25.71 
 
 		 1809 aa  98.6  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  26.59 
 
 		 1570 aa  98.6  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  26.59 
 
 		 1570 aa  97.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.36 
 
 		 1312 aa  97.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  26.28 
 
 		 983 aa  97.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  32.21 
 
 		 1393 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  27.37 
 
 		 1962 aa  96.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.25 
 
 		 1638 aa  95.9  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  23.56 
 
 		 1638 aa  94.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 		 1191 aa  91.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  29.74 
 
 		 1393 aa  91.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  24.59 
 
 		 1116 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 1293 aa  89.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.39 
 
 		 1649 aa  89.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 1649 aa  89.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  24.78 
 
 		 1312 aa  87.4  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  25.53 
 
 		 1300 aa  87  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.19 
 
 		 1645 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.53 
 
 		 1099 aa  85.9  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1099 aa  85.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  41.18 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 		 1659 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  30.74 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  24.75 
 
 		 1233 aa  84.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  51.85 
 
 		 1311 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.73 
 
 		 1191 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  24.26 
 
 		 1115 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 1648 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 1648 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 1648 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.19 
 
 		 1465 aa  84.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  48.54 
 
 		 1053 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  23.85 
 
 		 1705 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  23.85 
 
 		 1705 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 		 1706 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.95 
 
 		 1474 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  24.17 
 
 		 1634 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  24.31 
 
 		 1298 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1406 aa  79  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  28.38 
 
 		 1045 aa  79.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 		 1705 aa  78.2  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  46.32 
 
 		 887 aa  78.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  25.58 
 
 		 1683 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  27.94 
 
 		 1298 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.62 
 
 		 1669 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  27.94 
 
 		 1298 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>