115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1207 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 96 aa  191  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  40.62 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  42.11 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  42.71 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  41.67 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  40.62 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  35.05 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  42 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  41 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  38.95 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.56 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  33.68 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.67 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  36.46 
 
 		 94 aa  57  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  36.73 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  37.37 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  38.78 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  30.68 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  37.21 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  41.24 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  38.57 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1036  DNA polymerase beta domain protein region  35.48 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0795086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  26.09 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  32.98 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  32.95 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  28.09 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  32.97 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  40.48 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  40.32 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  32.29 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.04 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  40.22 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  32.29 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  34.44 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  36.36 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  33.82 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  39.68 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  30.68 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  24.18 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1728  hypothetical protein  38.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0250  DNA polymerase beta subunit  39.73 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  37.7 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  27.45 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  30.86 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  29.9 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  34.15 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  34.94 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  37.04 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  34.92 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  27.59 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  33.66 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  34.18 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  26.58 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  28.41 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  48.65 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  35.44 
 
 		 153 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  35.42 
 
 		 109 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  27.59 
 
 		 104 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 103 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  35 
 
 		 97 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  29.27 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  37.1 
 
 		 126 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  36.17 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>