More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0039 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1902  molybdopterin oxidoreductase  75.51 
 
 
691 aa  1127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0039  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
694 aa  1455  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 
898 aa  392  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 
893 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.66 
 
 
982 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  33.8 
 
 
982 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 
979 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.87 
 
 
983 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.2 
 
 
879 aa  377  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 
983 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 
983 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.78 
 
 
983 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.59 
 
 
983 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.78 
 
 
983 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.64 
 
 
983 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.73 
 
 
905 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
944 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 
967 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.02 
 
 
956 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  32.86 
 
 
957 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 
949 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
969 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.68 
 
 
984 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 
956 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.82 
 
 
984 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.63 
 
 
984 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.68 
 
 
984 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 
957 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.03 
 
 
959 aa  365  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
984 aa  363  5e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
984 aa  363  5e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
984 aa  363  5e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
984 aa  363  5e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.45 
 
 
966 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.05 
 
 
960 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 
952 aa  360  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 
960 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.11 
 
 
893 aa  360  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.86 
 
 
900 aa  359  1e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 
1000 aa  359  1e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.45 
 
 
948 aa  359  1e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.32 
 
 
977 aa  358  2e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
959 aa  357  3e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 
950 aa  357  3e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.87 
 
 
960 aa  357  4e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.52 
 
 
901 aa  357  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.45 
 
 
948 aa  356  8e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  32.5 
 
 
960 aa  356  9e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.12 
 
 
950 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.5 
 
 
960 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 
959 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
948 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 
951 aa  354  3e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.63 
 
 
960 aa  354  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 
950 aa  354  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.31 
 
 
959 aa  353  6e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.16 
 
 
946 aa  353  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.04 
 
 
953 aa  352  9e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.89 
 
 
948 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.74 
 
 
946 aa  352  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 
674 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.17 
 
 
973 aa  351  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.56 
 
 
947 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  32.31 
 
 
713 aa  350  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.26 
 
 
676 aa  349  9e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.36 
 
 
676 aa  348  3e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 
973 aa  347  4e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.02 
 
 
979 aa  347  5e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 
948 aa  347  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  31.54 
 
 
715 aa  346  9e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.54 
 
 
715 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.78 
 
 
688 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 
978 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 
904 aa  346  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.26 
 
 
718 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.86 
 
 
899 aa  344  3e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 
676 aa  344  3e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.32 
 
 
951 aa  344  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.97 
 
 
937 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30.75 
 
 
745 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  31.4 
 
 
715 aa  343  6e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.18 
 
 
959 aa  343  6e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.69 
 
 
929 aa  343  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  30.93 
 
 
716 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 
1440 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 
893 aa  342  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.02152e-05  hitchhiker  2.06048e-13 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 
947 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.02 
 
 
952 aa  341  3e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
927 aa  341  3e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.88 
 
 
959 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.49 
 
 
1424 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.72 
 
 
689 aa  340  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.28 
 
 
1440 aa  340  6e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.12 
 
 
677 aa  340  7e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.76 
 
 
959 aa  340  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 
1406 aa  339  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.9 
 
 
959 aa  339  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 
900 aa  339  1e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.93 
 
 
1421 aa  338  2e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.6 
 
 
994 aa  337  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>