221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3955 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  91.52 
 
 		 448 aa  844    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  910    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  64.06 
 
 		 448 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  56.24 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  53.08 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  30.56 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  29.28 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  28.57 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.54 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.9 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.67 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.88 
 
 		 458 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.95 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.02 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  30.13 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  29.28 
 
 		 474 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.92 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.68 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.67 
 
 		 454 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 657 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  27.71 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.74 
 
 		 505 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.55 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  24.9 
 
 		 505 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  25.65 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  31.58 
 
 		 677 aa  123  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.8 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  28.31 
 
 		 781 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.08 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 475 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 456 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.6 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.43 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.49 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.57 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.84 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  28.72 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.83 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  24.57 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.57 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.76 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  27.16 
 
 		 668 aa  117  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.07 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.04 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 		 685 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.91 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.32 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.23 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  27.14 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.39 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  23.93 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.39 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.7 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.43 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.08 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.91 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.15 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.16 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.74 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  29.25 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.99 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  28.08 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  28.57 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.99 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.99 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  25.89 
 
 		 504 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 504 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.57 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.81 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  27.11 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  27.11 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  26.45 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.49 
 
 		 680 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.49 
 
 		 680 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  23.61 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  24.95 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  26.25 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.81 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.15 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.87 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.81 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.92 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  24.27 
 
 		 486 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>