182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1587 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1587  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
438 aa  885  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.18349e-07  unclonable  4.30527e-12 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  86.14 
 
 
445 aa  781  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.67182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2791  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  99.32 
 
 
438 aa  880  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.98305e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1450  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  86.76 
 
 
428 aa  769  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.53151e-05  unclonable  9.46875e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3099  long-chain fatty acid transport protein, putative  91.59 
 
 
440 aa  824  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1397  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  88.81 
 
 
431 aa  789  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00928382  unclonable  2.43576e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1462  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  88.58 
 
 
431 aa  789  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00212901  unclonable  3.39472e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2866  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  91.14 
 
 
433 aa  801  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0131226  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2771  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  61.37 
 
 
434 aa  540  1e-152  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.76056e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3037  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.58 
 
 
441 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.00429e-07  normal  0.0267167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1618  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.58 
 
 
440 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  7.9524e-07  decreased coverage  1.70841e-09 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.64 
 
 
438 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.65967e-07  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.14 
 
 
440 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.36439e-08  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  55.74 
 
 
439 aa  492  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.12018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1414  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  56.39 
 
 
443 aa  492  1e-138  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.39159e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  55.26 
 
 
427 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  9.55558e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03124  hypothetical protein  43.54 
 
 
420 aa  349  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002852  long-chain fatty acid transport protein  41.67 
 
 
419 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0561  long-chain fatty acid transport protein  41.56 
 
 
428 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2269  outer membrane protein transport protein  41.26 
 
 
415 aa  327  4e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00153589  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000778  long-chain fatty acid transport protein  37.61 
 
 
432 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  39.37 
 
 
428 aa  290  5e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.35062e-07  hitchhiker  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  34.6 
 
 
419 aa  253  4e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  34.15 
 
 
412 aa  246  5e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  35.02 
 
 
422 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.75 
 
 
430 aa  239  6e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.32854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.26 
 
 
427 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  33.48 
 
 
414 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  33.85 
 
 
414 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.87 
 
 
421 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.87 
 
 
421 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.87 
 
 
421 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  32.74 
 
 
417 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  32.85 
 
 
453 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.09472e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  32.51 
 
 
415 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.26 
 
 
440 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.24 
 
 
437 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  2.85546e-12 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.24 
 
 
437 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.24 
 
 
435 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.24 
 
 
435 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.24 
 
 
435 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
448 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  29.24 
 
 
448 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
446 aa  220  4e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
446 aa  220  4e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  29.24 
 
 
446 aa  220  4e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
446 aa  220  4e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
446 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.03 
 
 
446 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.24 
 
 
446 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  32.13 
 
 
444 aa  213  4e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.26 
 
 
448 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.51 
 
 
450 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.84 
 
 
451 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.03 
 
 
448 aa  202  1e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  31.06 
 
 
445 aa  200  4e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52847e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  29.53 
 
 
437 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.54 
 
 
449 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.49 
 
 
449 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.49 
 
 
449 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.49 
 
 
449 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.49 
 
 
449 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69798e-10 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.9 
 
 
432 aa  198  1e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.21 
 
 
450 aa  197  2e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.12339e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  30.98 
 
 
442 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.91 
 
 
452 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.48311e-07  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.02 
 
 
428 aa  185  1e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  31.1 
 
 
429 aa  185  1e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  31.46 
 
 
432 aa  184  4e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.77 
 
 
451 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  28.11 
 
 
438 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  28.09 
 
 
464 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.17169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.51 
 
 
424 aa  164  4e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.55 
 
 
423 aa  163  4e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.71 
 
 
400 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.29 
 
 
426 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.93 
 
 
427 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.72 
 
 
421 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.65 
 
 
423 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.22 
 
 
421 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  26.56 
 
 
424 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.79 
 
 
421 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.13 
 
 
442 aa  134  2e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.91 
 
 
488 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  26.41 
 
 
422 aa  132  1e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.58 
 
 
401 aa  132  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  8.05243e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.34 
 
 
450 aa  128  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  24.89 
 
 
424 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  24.18 
 
 
429 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.42 
 
 
450 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.22 
 
 
437 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.53 
 
 
429 aa  120  4e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  24.95 
 
 
463 aa  120  4e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  26.01 
 
 
432 aa  119  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.49 
 
 
450 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.23 
 
 
415 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.72 
 
 
364 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.65 
 
 
450 aa  116  8e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  24.33 
 
 
482 aa  115  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.49 
 
 
442 aa  115  1e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.3121e-15  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>