99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0576 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 162 aa  317  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  64.6 
 
 		 106 aa  124  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  55.65 
 
 		 240 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  44.74 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  47.22 
 
 		 137 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  49.5 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  40.34 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  35.71 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  35.71 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  35.43 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  55.36 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  36.94 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  39.32 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  40.66 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  39.42 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  42.2 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  36.15 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  33.33 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  41.89 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  41.51 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  40.91 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  33.85 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  33.33 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.2 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  34.91 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  40.37 
 
 		 111 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  38.75 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  41.28 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.11 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  40.58 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  34.4 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.33 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  40.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  40.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  40.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  44.59 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  40.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  40.58 
 
 		 119 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  40.58 
 
 		 115 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  33.96 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  34.65 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  40.58 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  44.14 
 
 		 116 aa  47.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 		 121 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  37.5 
 
 		 120 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  40.58 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  38.57 
 
 		 109 aa  47.4  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  41.79 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  39.13 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  42.62 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  39.13 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.91 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  35.21 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  37.37 
 
 		 95 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  35.19 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  38.05 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  35.09 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  37.61 
 
 		 130 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  34.85 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.95 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  37 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  37 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  37 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  33.87 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.78 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.07 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  41.94 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  43.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 		 93 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 		 127 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  33.08 
 
 		 206 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  36.84 
 
 		 117 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  34.58 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  46 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  33.87 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.68 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.92 
 
 		 79 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  47.62 
 
 		 81 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  45.83 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  43.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 		 124 aa  40.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>