More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3509 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  56 
 
 
597 aa  649  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  57.45 
 
 
599 aa  655  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  54.24 
 
 
597 aa  647  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  56.02 
 
 
605 aa  658  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  57.21 
 
 
632 aa  687  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  2.76011e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
599 aa  1208  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  54.41 
 
 
600 aa  640  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  57.4 
 
 
599 aa  690  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  54.49 
 
 
602 aa  644  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  54.32 
 
 
597 aa  645  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  56 
 
 
597 aa  649  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  58.6 
 
 
616 aa  699  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  56.55 
 
 
600 aa  674  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.26 
 
 
597 aa  652  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  56.17 
 
 
597 aa  653  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  55.03 
 
 
595 aa  643  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  57.55 
 
 
602 aa  710  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  55.74 
 
 
612 aa  666  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  55.59 
 
 
604 aa  639  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  89.15 
 
 
599 aa  1092  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  55.39 
 
 
599 aa  649  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  56.95 
 
 
597 aa  675  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  54.18 
 
 
601 aa  640  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  57.62 
 
 
600 aa  698  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  54.67 
 
 
619 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  55.81 
 
 
593 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  53.14 
 
 
601 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  52.55 
 
 
615 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  54.18 
 
 
606 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  53.49 
 
 
607 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  54.83 
 
 
602 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  55.09 
 
 
606 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  52.33 
 
 
598 aa  616  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  57.25 
 
 
599 aa  612  1e-174  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  53.18 
 
 
602 aa  611  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  53.65 
 
 
599 aa  605  1e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  53.26 
 
 
603 aa  601  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 
606 aa  596  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  57.94 
 
 
602 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 
604 aa  595  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 
600 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  52.41 
 
 
596 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  51.64 
 
 
615 aa  583  1e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  57.55 
 
 
606 aa  585  1e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  52.67 
 
 
608 aa  577  1e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 
622 aa  573  1e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  51.17 
 
 
591 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.28 
 
 
611 aa  545  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  52.42 
 
 
606 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 
609 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 
609 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.55356e-10 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  41.21 
 
 
618 aa  475  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  42.18 
 
 
603 aa  468  1e-130  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  47.52 
 
 
590 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  43.36 
 
 
679 aa  458  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  45.12 
 
 
612 aa  448  1e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  42.99 
 
 
607 aa  441  1e-122  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  43.45 
 
 
677 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  44.09 
 
 
682 aa  427  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  40.22 
 
 
701 aa  416  1e-115  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 
607 aa  405  1e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
622 aa  407  1e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
604 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
602 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 
594 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 
604 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 
604 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  40.81 
 
 
605 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 
617 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  40.03 
 
 
635 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  41.19 
 
 
622 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
606 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
606 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 
649 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
603 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
607 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
612 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
606 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
609 aa  358  2e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
610 aa  356  6e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
603 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
592 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 
633 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.83 
 
 
610 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
610 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
613 aa  347  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 
616 aa  344  3e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  5.72274e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
652 aa  343  6e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
603 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.15 
 
 
610 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
610 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 
610 aa  340  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 
590 aa  339  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  37.56 
 
 
602 aa  339  1e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  35.04 
 
 
592 aa  338  1e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
660 aa  338  2e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
602 aa  337  3e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
602 aa  337  3e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
633 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
596 aa  336  9e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>