100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2118 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  100 
 
 
406 aa  825    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  59.8 
 
 
405 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  57.61 
 
 
408 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  59.45 
 
 
408 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.22 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.25 
 
 
407 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  38.02 
 
 
410 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  33.58 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  32.76 
 
 
408 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  33.5 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  36.05 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  34.07 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  36.83 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  33.25 
 
 
433 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
444 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  32.92 
 
 
415 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  35.61 
 
 
411 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  36.1 
 
 
411 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  35.75 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  34.32 
 
 
412 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  32.67 
 
 
409 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  33 
 
 
433 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  32.76 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  36.23 
 
 
410 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  30.96 
 
 
413 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  34.07 
 
 
431 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  29.41 
 
 
411 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  35.12 
 
 
416 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  34.67 
 
 
410 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  30.71 
 
 
413 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  34.65 
 
 
407 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  33 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  30.15 
 
 
407 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  29.9 
 
 
407 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  29.9 
 
 
407 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  34.76 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  29.9 
 
 
407 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  34.9 
 
 
409 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  36.12 
 
 
413 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  35.45 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  34.41 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  32.19 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  36.6 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  30.91 
 
 
406 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  34.41 
 
 
409 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  31.98 
 
 
400 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  29.97 
 
 
402 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  33.96 
 
 
373 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.21 
 
 
418 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  29.67 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  29.67 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.03 
 
 
421 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.88 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  25.3 
 
 
409 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.78 
 
 
436 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  23.46 
 
 
416 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25 
 
 
413 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.37 
 
 
412 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  23.37 
 
 
412 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  29.07 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  26.59 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.48 
 
 
178 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  27.09 
 
 
376 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.86 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
383 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.4 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  28.24 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.42 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  28.78 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.02 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  24.76 
 
 
817 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  23.72 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  22.88 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.41 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.69 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.67 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  24.11 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  25.42 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  26.72 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  21.77 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  25.08 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.68 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  22.82 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.73 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.9 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  25 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
513 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  23.46 
 
 
305 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.08 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4449  hypothetical protein  37.74 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  27.14 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  21.12 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  19.92 
 
 
240 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.6 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  21.05 
 
 
210 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.87 
 
 
392 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 
277 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  25.9 
 
 
207 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.74 
 
 
346 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>