268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2285 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  73.66 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  74.13 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  74.05 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  73.28 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  72.52 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  70.23 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  73.28 
 
 		 265 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  68.32 
 
 		 266 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  69.77 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  48.85 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  48.46 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  47.69 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  46.92 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  44.36 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  45.68 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  43.04 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  45 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  42.86 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  43.32 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  46.81 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  41.05 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  41.8 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  43.93 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  45.85 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.63 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  41.6 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  41.18 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  45.41 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  42.02 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  39.66 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  36.82 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  43.6 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  42.98 
 
 		 265 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  41.4 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  41.96 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  39.19 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  39.74 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  39.66 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  41.74 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  37.19 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  36.32 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.86 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.56 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  34.91 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  40.44 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  36.75 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  35.37 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  39.24 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  36.29 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  38.36 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  38.1 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  36.96 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  38.1 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  38.1 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  36.36 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.88 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.88 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  37.61 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  42.23 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 		 260 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  35.8 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  38.96 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  37.66 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  38.53 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  37.3 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  36.93 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  37.21 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  34.56 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  35.48 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  35.48 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  35.93 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  34.07 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  35.02 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  37 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  36.89 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  33.04 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>