More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2509 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  48.87 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  50.39 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  48.23 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  48.41 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  49.61 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  45.67 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  43.17 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  41.27 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  43.65 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  42.86 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.91 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.53 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.44 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  43.65 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.43 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.06 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  43.15 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  42.65 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  42.65 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  38.36 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  42.96 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.13 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>