More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0963 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  64.62 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  60.66 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  62.78 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  59.56 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  61.2 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  60.66 
 
 		 235 aa  191  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  57.3 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 210 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 248 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  56.68 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  56.68 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  56.68 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  61.54 
 
 		 209 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  61.54 
 
 		 209 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  60.99 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  55.25 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  58.47 
 
 		 232 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  56.02 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  57.92 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  57.38 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  57.69 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  61.5 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  60.57 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  54.95 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  56.67 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  55.49 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  55.49 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  54.26 
 
 		 269 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  54.84 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  59.78 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.08 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  54.04 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  59.46 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  54.92 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  53.23 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  52.38 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  49.26 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  53.26 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  51.31 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  54.95 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.38 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.52 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  52.38 
 
 		 207 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  52.38 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  55.43 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  52.78 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  51.43 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  58.33 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  50 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  55.49 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  58.73 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 292 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  50.27 
 
 		 277 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  51.37 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  52 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.46 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>