240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1041 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  76.04 
 
 
217 aa  354  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
220 aa  274  8e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 
219 aa  249  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  58.88 
 
 
223 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
229 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 
224 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 
225 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 
245 aa  237  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
225 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
225 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 
247 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 
269 aa  235  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
225 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  60.1 
 
 
216 aa  234  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
225 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 
226 aa  232  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
225 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  53.77 
 
 
225 aa  232  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  53.99 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  54.72 
 
 
245 aa  231  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  52.8 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  55.76 
 
 
225 aa  228  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 
225 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
218 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  53.05 
 
 
226 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
218 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  51.16 
 
 
223 aa  225  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
222 aa  225  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 
221 aa  225  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
228 aa  224  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
225 aa  224  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
231 aa  224  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
228 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  53.27 
 
 
229 aa  223  1e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
228 aa  223  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
222 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  52.11 
 
 
220 aa  223  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 
229 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
228 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  52.34 
 
 
241 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  53.24 
 
 
227 aa  222  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
228 aa  221  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  51.64 
 
 
232 aa  221  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
226 aa  221  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
243 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  53.05 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  52.58 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 
219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  48.84 
 
 
218 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
221 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  52.63 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
226 aa  218  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
221 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  52.34 
 
 
235 aa  217  8.999999999999998e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 
232 aa  217  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
225 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 
222 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 
232 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 
231 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 
231 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  51.42 
 
 
240 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 
230 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
231 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
231 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 
231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
225 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
222 aa  210  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
223 aa  210  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>