More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4204 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  97.59 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  96.79 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  93.17 
 
 		 249 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  92.03 
 
 		 251 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  92.03 
 
 		 251 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  92.03 
 
 		 251 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  91.63 
 
 		 251 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  96.39 
 
 		 249 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.13 
 
 		 251 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  83.87 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  81.45 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  86.08 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  84.68 
 
 		 255 aa  410  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  81.85 
 
 		 250 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  82.55 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  67.74 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  66.26 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  66.53 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.49 
 
 		 258 aa  353  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.26 
 
 		 269 aa  351  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.39 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.95 
 
 		 253 aa  345  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  62.1 
 
 		 258 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  66.81 
 
 		 256 aa  344  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  65.18 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.16 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.16 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.16 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.16 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.16 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  69.83 
 
 		 255 aa  339  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  64.41 
 
 		 250 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  65.31 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  61.29 
 
 		 252 aa  333  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.55 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.55 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.25 
 
 		 256 aa  329  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.55 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  66.95 
 
 		 250 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  64.34 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.25 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  59.67 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  58.06 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  57.26 
 
 		 267 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  57.26 
 
 		 267 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  55.56 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  55.16 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  58.92 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.24 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.33 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.33 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.1 
 
 		 398 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  54.03 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.43 
 
 		 368 aa  285  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.72 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  56.82 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.44 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  59.47 
 
 		 368 aa  284  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  52.63 
 
 		 269 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  55.83 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  56.65 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.14 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  53.72 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  49.25 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.28 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.28 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.24 
 
 		 259 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.59 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.28 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  53.6 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.91 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.61 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.44 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.41 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.41 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.63 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.25 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3098  Sec-independent protein translocase TatC  52.42 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.923548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  52.79 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.61 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.27 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  52.61 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.61 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  54.03 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  54.7 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  53.63 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>