More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0338 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  97.73 
 
 		 836 aa  1660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  100 
 
 		 836 aa  1714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.26 
 
 		 823 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  46.38 
 
 		 823 aa  720    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  97.73 
 
 		 836 aa  1656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.45 
 
 		 837 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  46.38 
 
 		 823 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  97.97 
 
 		 836 aa  1679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.87 
 
 		 840 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  41.3 
 
 		 851 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  39.47 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  39.23 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  39.23 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  39.23 
 
 		 809 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  39.1 
 
 		 809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  36.14 
 
 		 848 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  35.9 
 
 		 848 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  35.31 
 
 		 848 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  35.43 
 
 		 848 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  35.55 
 
 		 848 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  36.27 
 
 		 878 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.27 
 
 		 878 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  36.27 
 
 		 863 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  36.27 
 
 		 878 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  36.04 
 
 		 878 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  34.63 
 
 		 814 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  36.06 
 
 		 856 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  35.66 
 
 		 842 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.6 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.73 
 
 		 866 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  35.54 
 
 		 842 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  35.54 
 
 		 842 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  34.61 
 
 		 866 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  34.61 
 
 		 866 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  34.65 
 
 		 866 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  34.61 
 
 		 866 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  34.84 
 
 		 866 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  34.61 
 
 		 866 aa  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  36.44 
 
 		 888 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  36.44 
 
 		 873 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  36.44 
 
 		 888 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  36.32 
 
 		 888 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.29 
 
 		 859 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.53 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  36.2 
 
 		 888 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.02 
 
 		 877 aa  465  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  34.29 
 
 		 871 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  36.71 
 
 		 870 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  35.18 
 
 		 838 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.3 
 
 		 838 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  36.71 
 
 		 870 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  35.42 
 
 		 838 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  35.18 
 
 		 838 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.06 
 
 		 838 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  36.35 
 
 		 870 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  35.06 
 
 		 838 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.29 
 
 		 867 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  35.45 
 
 		 869 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  36.59 
 
 		 870 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  36.59 
 
 		 870 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  35.3 
 
 		 863 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  35.34 
 
 		 869 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  35.14 
 
 		 869 aa  445  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.14 
 
 		 869 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  35.34 
 
 		 869 aa  446  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.85 
 
 		 851 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  34.55 
 
 		 869 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  35.94 
 
 		 740 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  33.29 
 
 		 840 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  33.41 
 
 		 839 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  32.98 
 
 		 844 aa  406  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.33 
 
 		 861 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.23 
 
 		 880 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  32.85 
 
 		 901 aa  379  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.46 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  32.35 
 
 		 839 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.61 
 
 		 901 aa  373  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.25 
 
 		 886 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.73 
 
 		 851 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.2 
 
 		 871 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  31.21 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.01 
 
 		 866 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  31.33 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  31.1 
 
 		 833 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  30.51 
 
 		 833 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.02 
 
 		 930 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.58 
 
 		 884 aa  360  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.81 
 
 		 844 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0084  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.52 
 
 		 818 aa  354  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.3 
 
 		 835 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.17 
 
 		 872 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  31.19 
 
 		 939 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  32.52 
 
 		 839 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.61 
 
 		 867 aa  350  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.45 
 
 		 851 aa  350  6e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  32.16 
 
 		 837 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  31.17 
 
 		 914 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  31.05 
 
 		 913 aa  343  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  31.05 
 
 		 914 aa  343  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.37 
 
 		 1040 aa  343  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>