More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0826 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  360  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  91.3 
 
 		 184 aa  336  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  91.3 
 
 		 184 aa  336  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  64.64 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 185 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 185 aa  234  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  61.88 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  58.79 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  56.52 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  58.01 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 187 aa  214  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 184 aa  213  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  55.17 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  56.59 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 184 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 181 aa  197  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 186 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 184 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  50 
 
 		 188 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  50 
 
 		 188 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  193  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  190  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1448  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0706  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000018395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  46.96 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.25 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.35 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  50 
 
 		 194 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5315  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 186 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  50 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>