57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0422 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  49.65 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  49.65 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  56.78 
 
 		 157 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  35.12 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  35.12 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  36.1 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  47.32 
 
 		 449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  47.86 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  47.86 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  49.32 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  49.32 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  56.1 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  56.1 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  48.65 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  48.65 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  55.93 
 
 		 166 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  55.93 
 
 		 166 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  49.43 
 
 		 143 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  49.43 
 
 		 143 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  43.75 
 
 		 143 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  42.24 
 
 		 468 aa  92  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  40.18 
 
 		 156 aa  85.1  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  43.56 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  46.67 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.28 
 
 		 619 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.28 
 
 		 619 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  45.56 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.58 
 
 		 655 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  39.47 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  38.05 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  38.95 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  40 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38 
 
 		 574 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  36.94 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  36.9 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  30.29 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  36.04 
 
 		 582 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  33.33 
 
 		 933 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5951  CHAP domain-containing protein  42.2 
 
 		 188 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  34.86 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  36.17 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5979  CHAP domain-containing protein  42.86 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  32.89 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0046  CHAP domain containing protein  33.65 
 
 		 332 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  42.42 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4510  CHAP domain-containing protein  34.04 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0200  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.52 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.502395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44.19 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4183  CHAP domain-containing protein  32.98 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.73 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  34.41 
 
 		 560 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  48.48 
 
 		 530 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.92 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>