More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0640 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.51 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.94 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4162  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.51 
 
 		 958 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329616  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2705  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.41 
 
 		 308 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  hitchhiker  0.000105231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2523  precorrin-4 C11-methyltransferase  63.1 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0144072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.79 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.17 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  46 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.19 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.7 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.43 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.18 
 
 		 867 aa  236  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.38 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.02 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.02 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.19 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.43 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.88 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.97 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.71 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  51.59 
 
 		 273 aa  224  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.8 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.16 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.22 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.34 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.12 
 
 		 610 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  49.8 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.83 
 
 		 259 aa  218  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.82 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.44 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  44 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.22 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 626 aa  216  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.66 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.83 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.76 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.43 
 
 		 626 aa  208  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.1 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4344  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.34 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.53 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.27 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.53 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.87 
 
 		 269 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.2 
 
 		 598 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  48.4 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.57 
 
 		 266 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0808  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.62 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 		 287 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  39.52 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.79 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.71 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  41.43 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05151  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.96 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.190612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.92 
 
 		 275 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  48 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04841  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  38.55 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4243  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.96 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.56 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.91 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  40.73 
 
 		 614 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.7 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.37 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.96 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.7 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.7 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.16 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05141  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  39.04 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.614023  normal  0.388015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.86 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2923  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.680231  normal  0.0185874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.28 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1791  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.65 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.64 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.75 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.92 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.44 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.44 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.44 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.98 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.44 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>