More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1242 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  100 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  62.11 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  62.11 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  61.05 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  61.62 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  59.6 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  59.6 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  61.22 
 
 		 223 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  51.49 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  54.08 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.55 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.47 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  56.12 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.08 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  51.52 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  51.02 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.53 
 
 		 198 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  51.02 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  52.04 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  51.02 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.08 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  51.55 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 224 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.52 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  94  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  48.98 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50.52 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  44.44 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>